Rails3.1系になり、環境によってはアプリケーションを作成後、そのまま動かせない場合があるようです(詳細は調べていません。。。)。
Could not find a JavaScript runtime. See https://github.com/sstephenson/execjs for a list of available runtimes.
そんな時は、とりあえず以下をGemfileに追加してbundleすればOKです。
gem 'execjs' gem 'therubyracer'